結節性硬化症的手術治療方法如下：
1、綜合評估結節性硬化症的病情，如明確引發癲癇的結節位置，可通過傳統的開顱手術切除結節進行根治手術治療；
2、如通過常規檢查無法確定引發癲癇的結節位置，可能需通過侵襲性方法將顱內電極埋藏至腦內，探測導致癲癇發作的結節，明確位置後可能需進行二次開顱切除手術；
3、部分患者如癲癇發作較為廣泛、彌散，無法定位節點並進行局灶性切除手術，可通過刺激迷走神經抑制放電進行姑息性治療，也稱神經調控治療。