長期房顫可以產生很多後果，最嚴重的是由於血栓脫落導致腦梗死，長期房顫也會促進心衰的程度加重。對於房顫的人群，最主要的是預防栓塞以及控制心室率，預防心衰症狀加重。

在藥物上，要預防此類後果，一般要應用華法林或者利伐沙班等，預防血栓脫落的風險，以及應用β受體阻滯劑、地高辛等控制心率，預防由於心室率過度增快導致心衰症狀加重。如果是特發性房顫或者有手術指徵的房顫，可以選擇射頻消融手術根治房顫。