陣發性房顫患者的治療，也需要給予抗凝。陣發性房顫患者需要進行出血和缺血事件的評分，根據其評分來給予相應的抗凝治療。另外，陣發性房顫患者在進行射頻消融手術前，往往需要給予抗凝藥物的相關使用，包括治療前三個月的抗凝治療，以及治療後四周的抗凝治療，用於防止動脈血栓性事件的發生。

另外，陣發性房顫患者行消融手術前，需要做系統的相關檢查，明確有無甲狀腺功能亢進性疾病的存在，給予相對應的治療。陣發性房顫患者給予藥物復律或者射頻消融手術復律，可使心室率恢復竇性心律的狀態，而減少併發症的發生。