胸腔鏡肺葉切除術後引起疼痛原因是由於傳統手術切口比較長，損傷較大，病人術後疼痛感比較顯著。如果是胸腔鏡的肺葉切除，採取微創手術方式，胸壁切口往往比較小，會對局部的胸壁損傷也比較小，術後的疼痛感也比較輕。兩種手術方式造成病人術後疼痛的原因大體相同。最關鍵的原因為手術過程當中，由於胸壁切口以及操作過程中的器械，對胸壁局部的神經以及肌肉組織形成的損傷，從而胸部手術以後病人會出現疼痛感。

早期的疼痛可通過止痛泵有效治療，以及口服鎮痛藥物幫助病人有效減輕疼痛，並且採取胸帶外固定的方式，可限制病人咳嗽時胸廓的活動幅度，一定程度上也可減輕術後病人的疼痛。