蟯蟲病最佳的治療辦法是用驅蟲藥治療，可以快速有效地達到治癒效果。由於感染途徑和生活習慣的特殊性，治療需要重複1-2次，口服藥物可以選擇阿苯達唑。阿苯達唑可以頓服，隔兩週重複一次。還可以選擇甲苯達唑，主要是抑制蟲體攝入葡萄糖，治癒率可以達到95%上。還可以應用抗蟲啉，為廣譜的驅蟲藥，通過抑制蟲體膽鹼酯酶，達到驅蟲的作用，驅蟲藥短期治療即可。

還可以外用藥治療，在便後或者是睡前用溫水洗淨肛門，再用含百部浸膏和甲紫的蟯蟲軟膏，通過細管擠入肛門內，可以阻止蟯蟲的產卵，達到止癢和減少自身感染的目的。