牛奶過敏2級主要是由免疫球蛋白E介導的過敏性疾病，其中主要的過敏原是酪蛋白和乳清蛋白。對牛奶過敏的患兒，建議喝深度水解奶粉和氨基酸配方奶粉。
1、深度水解奶粉：深度水解奶粉是將其中的大分子蛋白切割，變成短肽或者氨基酸結構的特殊奶粉，更容易被患兒吸收，對腸道無負擔，有助於維持患兒的腸道健康。同時該類奶粉與普通奶粉的營養成分相同，也能為患兒提供足夠的營養支持，適用於輕度和中度的牛奶蛋白過敏的患兒。但也有少部分患兒對深度水解奶粉反應不佳，因此初次使用時要注意不良反應；
2、氨基酸配方奶粉：氨基酸配方奶粉中不含有大分子蛋白，是由遊離氨基酸組成，不會誘發過敏反應，適用於嚴重過敏的患兒。
此外，其它動物奶粉，如羊奶粉，均含有一定數量的酪蛋白，存在交叉過敏的可能，一般不推薦。