亞急性甲狀腺炎屬於自限性疾病，當疾病進展到一定程度之後會自行好轉，逐漸恢復到健康狀態。亞急性甲狀腺炎治療主要考慮以下幾種情況：

1、緩解症狀，患者就診時主訴頸部疼痛，影響睡眠，甚至出現發燒，此時需考慮採用非甾體抗炎等藥物對症治療，大部分症狀可得到迅速緩解和控制，隨病程進一步進展，機體自我修復後症狀基本消失。如使用非甾體抗炎藥無效，不能較好控制疼痛或發燒症狀，可短期使用糖皮質激素，避免長久使用糖皮質激素，否則會產生依賴性；

2、甲狀腺被破壞，不能合成甲狀腺激素，出現甲狀腺功能減低，從而出現甲減症狀，如記憶力下降、怕冷、手腳發脹、體重增加等，使患者處於萎靡狀態，此時可臨時給予甲狀腺激素替代治療，即使患者有明顯甲亢症狀，也無需藥物治療。如果甲亢第一階段症狀較明顯，出現心悸，可對症使用β受體阻滯劑穩定心率。

由於亞甲炎患者甲狀腺變大、變硬，容易形成甲狀腺結節或者甲狀腺腫大的誤區，其實隨著炎症消除，自我修復，症狀可逐漸減輕，無需手術治療。