橋本氏甲狀腺炎最典型的症狀是甲狀腺腫大和甲狀腺功能減退。患者在疾病初期通常沒有症狀，隨著病情進展會出現甲狀腺的無痛性腫大，質地非常韌，很多患者就是摸到頸部腫塊或者看到頸部變粗前來就診。70%患者因甲狀腺腫大而出現壓迫症狀，壓迫氣管可出現呼吸困難，壓迫食管可出現吞嚥困難，壓迫聲帶可出現聲帶麻痺，壓迫血管會出現面部水腫。

橋本氏甲狀腺炎還會出現甲減症狀，20%-30%的患者首次就診表現為甲減，或者在疾病後期發展為甲減，甲減主要症狀包括幾點，第一是低代謝症候群，包括易疲勞、怕冷、體重增加、行動遲緩、熱能生成減少，體溫可以較正常人偏低。第二是精神神經系統症狀，輕症會出現記憶力、計算能力、理解能力和注意力減退。如果是比較嚴重的患者，可以表現為痴呆、妄想、木僵、嗜睡或者驚厥。第三是皮膚改變，顏面虛腫、表情呆板、鼻唇增厚、毛髮乾燥稀疏、指甲厚而脆，表面常有裂紋。第四是消化系統病變，表現為食慾減退、便秘等。最後是心血管系統病變，會表現為心率減慢、心輸出量減少等。