橋本氏甲狀腺炎是遺傳因素和免疫因素相互作用導致的自身免疫性甲狀腺炎症，標誌性抗體甲狀腺過氧化酶抗體會增高。

現在針對橋本氏甲狀腺炎沒有確切治療藥物。可採用中醫治療調節免疫因素；或應用免疫藥物。

橋本氏甲狀腺炎是甲狀腺逐漸破壞的過程，最終會發展成甲狀腺功能減退。如果發展到甲狀腺功能減退，要用甲狀腺激素替代治療，建議患者定期複查甲狀腺功能，檢查甲狀腺功能是否好轉。如果複查沒有好轉，醫生要調節劑量，直到甲狀腺功能恢復正常。

目前多采用替代治療，效果較好，患者不必過於擔心。如果檢查發現甲狀腺激素過低，需要補充治療。