完全心內膜墊缺損分型為部分型，包括過渡型和完全型心內膜缺損。部分型包括原發型房間隔缺損及二尖瓣瓣裂，這種類型下的二尖瓣、三尖瓣的瓣環基本是完整，只是有小裂隙，導致二尖瓣關閉不全，左心室收縮時血液會反向流向左心房，不合並室間隔缺損。過渡型包括原發型房間膈缺損、分裂二尖瓣和較小的室間隔缺損，室間隔缺損位於心室的流入道部分，但此時二尖瓣、三尖瓣仍是分開。

完全型有原發型房間隔缺損，較大的流入道室間膈缺損，有共同房室瓣，簡單的說就是兩個房間各自的大門沒有門框，只好湊成一個形狀和功能都不完全的公用通道，還要發揮其二尖瓣和三尖瓣的功能。但是這個公用通道在二尖瓣、三尖瓣上的分配卻不一定均勻，可能一側大，一側小。也可能是連接二尖瓣的腱索栓住右心室，更有可能右心室左心室根本就沒有腱索。