目前臨床上治療腎盂癌的經典手術方式為半尿路切除術，即切除患腎及全段輸尿管包括輸尿管開口處的部分膀胱，以防止在殘留的輸尿管內再次發生腫瘤。手術方法分為開腹手術、腹腔鏡手術、機器人手術等。其中以腹腔鏡腎盂癌根治術最為常見，在患者腰部做3個小切口，通過腹腔或後腹腔的途徑將患腎、輸尿管一集輸尿管開口處的部分膀胱一併切除。手術時間大概需要2-3小時。