強直性脊柱炎與遺傳密切相關，但並非100%遺傳。正常人發病率僅佔0.2%-0.3%，通常不超過0.5%。如果家中一方患強直性脊柱炎，則子女遺傳發生率相比正常發生率高出很多，通常可達15%-25%，但並非代表下一個子女100%罹患強直性脊柱炎。

已經發現HLA-B27，即人類白細胞抗原B27與強直性脊柱炎發病密切相關，發現強直性脊柱炎青年男性患者較多，存在家族聚集傾向，若爺爺、父親、兒子檢測HLA-B27均呈陽性，則發病幾率較大。