載藥微球治療的侷限性與單純肝動脈化療栓塞的侷限性大致相同，其缺點如下：

1、如果採用單一的肝動脈栓塞治療可能導致腫瘤栓塞不徹底或者壞死不完全，即腫瘤細胞滅活不夠；

2、介入栓塞後腫瘤微環境缺氧狀態刺激殘存的腫瘤細胞，分泌血管內皮生長因子促進血管生成因子釋放，誘導腫瘤邊緣血管再生，從而導致腫瘤的復發甚至轉移；

3、栓塞後易受到肝功能影響；

4、如果為少血供的腫瘤，則治療效果可能不佳，因此肝癌必須聯合手術或者非手術的其它治療手段，取得更好的效果。包括外科手術切除、微波消融、酒精消融等局部的物理方式，實現增加療效的目的。