系統性血管炎的併發症主要是供應的血管涉及病變，以及血管供應的臟器出現壞死和功能障礙。根據累及的血管部位不同而出現不同的表現，如累及到肺會出現咳嗽、哮喘、咯血；累及到眼部，可導致失明；累及到腎臟血管時，會導致腎功能急劇下降、肌酐急劇升高，甚至高血壓；累及到皮膚會導致皮膚潰爛，如手指和腳趾的潰瘍，甚至壞疽。