女性生殖器結核患者僅為輸卵管受累時，在輔助生殖技術幫助下受孕率無明顯變化，但子宮內膜受累時患者妊娠難度增加。

不孕是生殖器結核主要症狀，生殖器結核患者40%-50%可能出現不孕。因為輸卵管首先受累，影響精子輸送，會導致不孕。子宮內膜結核會妨礙受精卵著床，造成不孕或流產。體外受精、胚胎移植是結核性不孕患者獲得妊娠的最好選擇，尤其是病灶侷限於輸卵管、卵巢的患者，當病變累及子宮內膜、宮腔粘連時妊娠率下降。