新生兒腸梗阻的原因比較多，常見的原因如下：

1、消化道畸形：比如新生兒有兩副腸子，新生兒特有的環形胰腺、腸子打結或多一段等。還有空腸閉鎖，有的空腸閉鎖像蘋果皮一樣是多個階段閉鎖，還有局部的閉鎖，還有像風帽狀的空腸，腸腔內部就有一個小孔，都會造成新生兒的腸梗阻；

2、消化道腫瘤佔位：比如腸息膜上有囊腫壓迫腸管，也會引起新生兒腸梗阻。

新生兒腸梗阻的原因各式各樣，醫生在術前要通過B超、CT，核磁共振等各種檢查明確病因，積極對症治療，一般預後都比較好。