肝內膽管細胞癌的惡性程度較高，若不採取干預手段，從早期發展至晚期大概需6-12個月，如果發現較早，進行肝內膽管癌手術後2年生存率大概在50%。目前肝內膽管細胞癌的治療分為化療與靶向免疫，但以化療為主，可提高生存率。
肝內膽管細胞癌的惡性程度比肝細胞性肝癌嚴重，易復發轉移。發病原因可能與肝內膽管結石、肝炎相關，所以出現肝炎或肝內膽管結石的患者，需定期複查B超、腫瘤指標以及肝臟增強CT，以儘早發現腫瘤。