急性梗阻性化膿性膽管炎大部分是先梗阻後出現化膿。梗阻通常由結石引起，結石掉到膽管裡，完全堵塞膽管，而整個肝臟一天中分泌500-800ml的膽汁，堵塞後可造成大量膽汁淤積，結石本身伴有細菌感染，大量的細菌在膽管內繁殖引起大量的毒素釋放，同時大量的細菌入血引起發燒、腹痛，出現大汗淋漓，因為菌血症、敗血症而出現休克，甚至有可能出現神經系統症狀。若處理不及時，隨時有可能出現生命危險。