腦積水在臨床上需要使用藥物治療，具體的藥物包括利尿劑如雙氫克尿噻、速尿、甘露醇等。大多數中度腦積水患者可以使用山梨醇進行治療，這種藥物對患者的刺激性相對較少。如果病發有蛛網膜粘連，可以使用激素進行治療，及時消炎、抗菌。也可以使用手術治療，經過腰椎進行反覆穿刺引流，使腦部的積液從此滲透出去。

其他手術治療適用於腦部壓力較高的症狀，手術主要包括解除梗阻手術、腦脊液分流術，前者是治療腦積水的首選方法，後者需要根據腦積水的部位分區進行。雖然手術效果好，但在術後容易出現併發症，例如感染、癲癇、視神經損傷等。