如果兒童患有腦積水，治療起來比較困難，主要是對症處理。如果有少量的積水，可以使用口服的利尿藥，一般能夠使腦積水症狀得到緩解。

如果腦積水的容量過大，可以考慮靜脈點滴20%的甘露醇、速尿或者地塞米松等，能夠很好的起到利尿的效果。如果腦室內的壓力超過250mmH2O，則必須考慮採取手術的方法進行治療，可以在腦外科做分流手術。在治療腦積水時也要酌情考慮針對病因進行治療，如果有顱腔內感染或者顱內出血等疾病，要及時進行抗感染和止血治療。

如果是顱內腫瘤或者先天性頭顱生長畸形等原因導致的腦積水，可以酌情考慮手術治療。