小兒麻痺症和小兒腦癱都會引起兒童運動功能的障礙，但是兩者有本質的區別：首先，發病的原因。小兒腦癱的發病主要和圍生產期的不良因素有關係，比如兒童在出生前有宮內的感染、缺氧等情況；在出生時屬於早產兒或者有新生兒的窒息；在出生以後患有膽紅素腦病或者顱內出血等不良因素。

小兒麻痺症是由於感染了脊髓灰質炎病毒引起的，造成運動功能的障礙。其次，表現為症狀的不同。在兒童患有小兒麻痺以後會出現運動的障礙，並且由於神經的營養障礙出現一側肢體的萎縮，腦性癱瘓的症狀主要是運動發育的落後以及肌張力的異常。