神經內鏡第三腦室造瘻術是目前治療梗阻性腦積水的首選方法，具有緩解症狀迅速，併發症輕微，費用較低的明顯優勢。尤其由腫瘤引起的梗阻性腦積水，如松果體區腫瘤合併梗阻性腦積水。內鏡下的第三腦室造瘻術可以迅速並安全地解除顱內壓症狀，改善病情，還可以同時行內鏡腫瘤活檢術，進一步為治療提供病理學依據。腦室鏡手術的其它適應症還有導水管支架成形術，治療中腦導水管狹窄，透明隔造瘻術治療非對稱腦積水，第三腦室造瘻術治療小腦扁桃體下疝畸形、脊髓空洞症合併腦積水等。可在緩解腦積水的同時治療脊髓空洞症，避免行後顱窩減壓開顱手術。
神經內鏡下手術，在手術者手術技術達到一定程度以後，可以開展腦室內腫瘤手術，當然是指血供比較少的腫瘤，止血相對比較容易的手術。