腎臟積水導致的腎實質變薄，即便進行手術或者解除腎臟的積水以後，腎實質也不能恢復至正常。由於人體的腎臟單位是一種不可再生的組織器官，一旦發生損害或者發生缺失以後則不能再生。

因此，對於腎臟損害出現腎功能衰竭的狀態，需要進行外源性的腎移植，達到恢復正常濾過的作用，而腎臟的自身不能恢復至原有的狀態。因此，對於腎臟積水的患者，從原則上應儘早進行治療，避免腎臟實質受到壓迫以後導致有效腎單位缺失，而出現腎皮質變薄的現象。此種情況在早期及早的糾正以後可以挽救腎臟的功能，但是如果腎積水時間比較長，已經發生腎實質變薄，出現腎功能下降，則即便糾正引起腎積水的病因以後，腎實質也不能恢復至正常的厚度。