腎積水疼痛可以應用吲哚美辛栓、消旋山莨菪鹼、哌替啶等藥物治療，必要的時候給予手術治療。腎積水引起的疼痛主要是由於積水對腎盂和輸尿管進行牽拉、腎臟體積增大對腎臟包膜牽拉導致。

吲哚美辛栓具有消炎止痛作用，在臨床上最常應用。消旋山莨菪鹼具有解除痙攣的作用，對於輸尿管結石引起的腎積水效果更好。

哌替啶屬於更強效的止痛藥，在上述兩種藥物治療效果比較差的情況下應用。腎積水止痛只是對症處理，要從根本上解決問題，首先應該明確腎積水的原因。比較常見的是前列腺增生、腎盂和輸尿管結石、腎盂輸尿管連接處狹窄和腫瘤等等，這些疾病通常採用手術治療，只有從病因上解決問題，才能永久緩解疼痛。