腎積水不能自行消除，針對檢查發現腎積水的患者，應該進一步檢查尋找腎積水的原因，只有去除病因，腎積水才有可能消除。

如因懷孕增大的子宮壓迫膀胱、輸尿管引起的腎積水，待胎兒足月分娩以後腎積水會逐漸消除。輸尿管的結石梗阻需經碎石治療、排石以後，輸尿管完全通暢，腎積水才能逐漸緩解。輸尿管反流引起的腎積水，需解除下尿路梗阻，降低膀胱內壓後，腎積水才能消除。先天性因素，如腎盂輸尿管連接部的狹窄，需手術切除狹窄段，腎盂輸尿管重新成形以後引流通暢，才能使腎積水得到緩解。

部分患者存在影像學的腎積水，雖然影像學提示腎盂擴張，但是尿液引流通暢，其不能稱為臨床意義上的腎積水。