顱內血腫清除術的步驟，首先經過CT或者核磁共振，根據神經影像學檢查判斷血腫大致位置，設計合理的手術切口。比如對於基底節區的顱內血腫，常規採取顳葉的馬蹄形切口，將頭皮切開之後通常翻向顳下，用電動開顱鑽或者氣動開顱鑽進行顱骨打孔。之後用專用銑刀裝置進行顱骨切開，可以將顱骨骨瓣取下進行硬腦膜切開。切開後就顯露腦組織，根據術前神經影像學定位，採取離血腫最近部位的皮層進行切開，要注意儘可能避開重要功能區的皮層，從非重要功能區臨近血腫較近的位置切開皮層，逐漸顯露血腫，在顯微鏡下將血腫逐漸吸除，在徹底清除血腫之後，必要時還需要留置血腫殘腔的引流管。

其次，根據顱內壓情況，決定是進行硬腦膜縫合、顱骨骨瓣復位固定，還是需要棄去骨瓣進行去骨瓣減壓。如果術前患者已經發生腦疝，血腫清除之後，顱內壓仍偏高，可以考慮顱骨去骨瓣減壓。而如果血腫清除較滿意，或者術前無腦疝，清除血腫後，顱內壓降低較明顯，可以進行顱骨骨瓣復位，用小鈦釘、鈦板將顱骨骨瓣復位到原來的骨窗部位，恢復起來會比較好，也能有效避免將來二次手術進行顱骨修補。