對於雙腎積水患者，需要考慮雙腎積水病因以採用針對性治療。雙腎積水患者常見原因是下尿路存在梗阻即膀胱與尿道，對於男性患者常見原因是由於前列腺疾病，中老年患者主要是由前列腺增生所導致。可通過B超、尿流率甚至內鏡明確診斷，確診後可採用手術方式切除增大的前列腺以恢復患者尿道通暢性。

對於女性患者常見原因是膀胱頸部梗阻，也可通過經尿道手術方式進行治療。若梗阻部位發生在尿道，根據其不同情況可採用尿道擴張或狹窄段切除再吻合方法進行治療。同時需要警惕雙腎積水梗阻部位可能來源於雙側輸尿管，比如雙側輸尿管結石，必要時同時處理雙側輸尿管結石以恢復患者泌尿系統通暢度。