房間隔缺損在進行超聲心動圖檢查的時候，可以出現右心房、右心室增大，右室流出道增寬，室間隔與左室後壁呈同向運動，房間隔中部可以出現局部回聲失落，或者是房間隔連續性中斷，可以通過超聲檢查來測量房間隔缺損部位的大小。

在進行彩色多普勒檢查的時候，可以明確血流的方向，可見分流血流束自左心房缺損部位流向右心房，並且可以通過測量血流的速度來估計分流的血流量。一般通過超聲心動圖和彩色多普勒檢查，就可以明確診斷。