懷孕兩個月進行同房，有可能會造成胎停的不良後果，因為在懷孕兩個月時，胚胎本身發育不穩定，激素水平也不穩定，所以在這期間不能夠進行性生活。進行性行為對身體健康不利，會造成陰道組織黏膜水腫，子宮的收縮，有可能會引起胎兒停止發育，甚至會造成流產等後果。

如果有明顯的陰道出血、腹痛現象，需要及時去醫院進行檢查B超、血清中的Hcg和孕酮數值，如果有激素水平下降，則提示是流產的徵兆，需要臥床休息，及時選擇藥物保胎治療一週後複查。如果已經確定胎停，需要採取相應的流產措施，預防感染等併發症的發生，流產後10天或者下一次月經乾淨後也應該B超複查，半年後再進行備孕。