慢性腹瀉可採用中醫或西醫治療，西醫治療常使用止瀉作用的藥物，如思密達等。有一部分是通過降低腸道蠕動功能的藥物；還有一部分是調整腸道菌群的藥物，如益生菌、雙歧桿菌等。慢性腹瀉病人還需根據情況酌情補充液體、維生素、氨基酸、脂肪乳劑等營養物質，糾正水、電解質、酸鹼平衡紊亂和營養失衡。中醫方面針對慢性腹瀉，根據具體症狀辨證論治，主要分為脾虛、腎虛及肝鬱這三個方面，針對不同證型對證施治。

具體用藥請結合臨床，由醫生面診指導為準。