新生兒胎糞吸入綜合徵在新生兒期是一種常見的疾病，也屬於危重症。主要表現為胎兒在分娩的過程中吸入汙染的羊水，尤其是三度汙染羊水，可以造成新生兒肺部病變，由於羊水中有被胎糞汙染大的顆粒，可能這些顆粒會堵塞新生兒的小氣道，造成新生兒出生以後發生呼吸困難。

如果在劇烈哭鬧或者是在機械通氣過程中有時候會發生肺氣漏，也就是氣胸，加重患兒的呼吸困難。吸入綜合徵治療主要是抗感染治療，必要的時候在醫生的指導下可以給予輔助通氣治療。