腎結核晚期併發症較多，常見的併發症如下：

1、膀胱攣縮：出現於腎結核早期，通常症狀不顯著，可能僅提示尿液中有紅、白細胞異常，隨著疾病進展，逐漸出現排尿刺激症狀，如尿頻、尿急、尿痛。早期症狀是由於結核桿菌刺激到膀胱壁引起，後期則因為膀胱壁發生結核性膀胱炎，最終導致膀胱攣縮，而這種攣縮，嚴重時1小時可以有數次排尿，因此影響患者生活質量；

2、血尿：早期血尿可能是因為結核性膀胱炎在排尿時收縮所引起，通常呈排尿終末血尿，如果腎結核侵犯血管，會出現全程無痛性肉眼血尿，如果有血塊通過，可能會造成腰部疼痛症狀，如果伴有梗阻，出現積水，甚至積膿，患者可能會出現腰痛的症狀，甚至腹部腫塊的表現；

3、感染症狀：尿液常呈洗米水樣，全身症狀主要表現為結核中毒症狀，如午後低熱、盜汗、乏力等，約有75%的可以合併生殖系統的結核；

4、慢性腎功能不全：如果雙側腎結核或者一側嚴重腎結核導致對側腎積水較為嚴重，這時會出現慢性腎功能不全，如貧血、乏力、水腫、噁心等，嚴重時可以突發無尿。