房間隔缺損可按照缺損大小分類，缺損在6mm以內為小型缺損；6-12mm為中型缺損；＞12mm為大型缺損。同時房間隔缺損也可以分為原發性與繼發性，原發分型是心內膜墊缺損，繼發分型也可以分為上腔型、下腔型、中央型或混合型等。

通常小型房間隔缺損對寶寶身體發育影響較小，部分患者在1-2歲之內有可能恢復。中到大型缺損恢復幾率較低，位置較好者，可通過介入手段治療，一般對寶寶身體發育不會有影響。