如果是直徑比較小的中央型房間隔缺損，直徑＜5mm，通常不會對心臟和人體的健康產生過大影響。如果中央型房間隔缺損直徑偏大，可能導致左向右分流加重，引起右心功能不全甚至右心衰竭，嚴重者可能會出現肺動脈高壓。

正常人的心臟有兩個心房，分別是左心房和右心房，左心房內為動脈血，右心房內為靜脈血，因為心房中間有完整的房間隔相隔，正常情況下左右心房互不相通。如果胎兒在母親體內時，由於各種原因導致房間隔未能完全融合，出生之後遺留異常的通道，通常稱之為房間隔缺損。如果出現中央型房間隔缺損，左房的動脈血會一直向右房分流，導致右房負荷增加。如果缺損直徑較大，負荷會逐漸加重，甚至會導致右心負荷過重，形成右心功能不全甚至右心衰竭。另外長期的左向右分流可能造成肺動脈壓力升高，甚至會造成嚴重的肺動脈高壓，可能危害到患者的健康乃至生命。