膽汁反流分為生理性和病理性，很多人在生理情況下就有膽汁反流，不會造成嚴重炎症，也不會造成嚴重後果，這時不需特殊治療，更不用根治。病理性膽汁反流往往見於膽囊切除患者，即把膽囊儲存膽汁器官切除，膽汁會隨時分泌，引起膽汁反流，造成膽汁反流引起胃炎，這時需要治療。

治療方法主要有三種藥物：首先是胃動力藥，讓胃裡的膽汁很快流到十二指腸或更遠部位，包括嗎丁啉、莫沙必利等藥物；還有胃黏膜保護劑，服用胃黏膜保護劑後，讓反流到胃的膽汁不會對胃產生更多的炎症和刺激；還有患者在飲食方面的注意等。