反流性食管炎和膽汁反流性胃炎屬於兩種疾病，區別是反流性食管炎指胃內容物經過賁門、食管，然後通過口腔排出或出現症狀。膽汁反流性胃炎指十二指腸內容物，通過幽門排到胃裡，所以是兩個概念。

反流性食管炎是指胃內容物通過賁門排到食管就進入食管，這時對食管會引起刺激，而膽汁反流性胃炎指的是十二指腸內容物通過幽門進入胃內，對胃內有刺激，所以兩個是不同的情況。在臨床上反流食管炎更多表現出反酸、燒心症狀，如果是膽汁反流性胃炎，更多表現出中上腹、胃部不適，可能出現噁心的表現。