幼兒川崎病的治療費用主要是與患兒的病情嚴重程度有關，在早期急性期，如果有明顯的高熱、炎症反應以及心肌受累，就需要用免疫球蛋白衝擊治療，這種治療費用就比較高，大約要3-5萬元左右。

而對於輕症的患兒，一般只服用口服藥物以及對症治療，患兒的治療費用就會比較低。而到了晚期，如果出現了嚴重的冠狀動脈狹窄、閉塞或者動脈瘤，需要外科手術或介入治療，治療費用也是比較高的。