胃底間質瘤指的是胃底部位發生的間質瘤，胃間質瘤的好發部位主要是在胃壁間葉組織發生的腫瘤，間葉組織是結締組織。根據危險度可以分為低危、中危和高危三種情況。

危險度主要根據腫瘤大小以及核分裂象分，具體如下：

1、如果腫瘤大小＜5cm，50高倍視野下的核分裂數目如果在5個及以下的認為是低危間質瘤；

2、中危間質瘤指腫塊5-10cm，同時核分裂象＜5個；如果腫塊＜5cm，但核分裂象5-10個，認為是中危間質瘤；

3、腫塊＞10cm，核分裂象＞10個，是高危間質瘤。腫瘤5-10cm，同時核分裂象又是5-10個，屬於高危間質瘤，以手術為主治療。