複方甲硝唑陰道栓不能治療宮頸糜爛，複方甲硝唑陰道主要治療由於厭氧菌感染引起來的炎症，比如滴蟲性陰道炎、細菌性陰道炎等，此時可以用複方甲硝唑陰道栓。宮頸糜爛又稱為宮頸柱狀上皮異位，在雌激素影響下，使宮頸管柱狀上皮外移，異位到宮頸表面，由於這種柱狀上皮菲薄，可以看到下面的宮頸組織，而看起來宮頸組織呈鮮紅、糜爛樣。

宮頸糜爛通常由雌激素引起，無需特殊治療，是一個生理的過程，但是伴發炎症後需要治療。如果患者有滴蟲性陰道炎，或者是細菌性陰道炎，同時導致宮頸感染，這時用藥可以改善因為炎症引起的臨床症狀，但是對於治療宮頸糜爛本身無效。