膽汁從肝臟分泌出來，儲存在膽囊裡，再經過膽管排洩，膽管經過十二指腸乳頭，排洩到腸道中。遇到幽門功能不全的情況，或者發生疾病造成嘔吐的情況時，膽汁經過十二指腸，通過幽門反流到胃，再反流到食道的過程，稱為膽汁反流。膽汁反流經常會引起症狀，引起膽汁反流性胃炎，引起食道損傷情況，另外還可能引起呼吸系統的疾病。膽汁反流到口腔之後，引起咽部刺激，造成呼吸道症狀，這是膽汁反流的過程。