新生兒窒息程度不同，危害的程度也不同。新生兒胎齡越小，即早產的時間越早，出現窒息以後對於臟器功能的損害會比足月新生兒更嚴重。

如果窒息時間偏長，窒息程度比較重，會出現不同程度的肝功能、腎功能、大腦損害。如果窒息時間特別長，急救不及時，可能出現比較嚴重的腦實質損害，比如出現抽搐、驚厥等臨床表現，可能會留有後遺症。如果窒息時間短，窒息程度輕，通常不會造成特別明顯的危害。