幼兒孤獨症為遺傳因素和環境因素共同作用的結果。具體如下：
1、遺傳因素：基因變異，從父母遺傳來的。比如有幾十種基因變異都會導致孤獨症。具有相同遺傳基因的孩子，比如孤獨症兒童的弟弟妹妹，再得孤獨症概率明顯大於沒有孤獨症兒童的弟弟妹妹們；
2、環境因素：具有同樣基因變異的孩子，有些會得孤獨症有些卻不會，因為環境因素不同。比如媽媽懷孕時經常接觸有毒物質、病毒感染、營養缺乏，尤其葉酸和不飽和脂肪酸的缺乏，或者媽媽心理不健康，都會增加寶寶得孤獨症的風險。寶寶在生後6個月以內的環境也較重要，比如早產、嚴重黃疸、嚴重心理創傷等不利因素也會增加寶寶得孤獨症的風險。有些爸爸媽媽會自責，認為自己忽略對孩子的陪伴，經常讓孩子自己看電子產品導致孤獨症，答案是否定的。生活環境中和人互動減少不是導致孤獨症的原因，而是強化孤獨症的基因和環境因素影響，導致孤獨症表現更明顯，因此爸爸媽媽對寶寶的陪伴較為重要。