心包內惡性畸胎瘤的治療原則為早發現、早治療，若心包內惡性畸胎瘤早期，畸胎瘤生長侷限於心包內，未對心臟、動脈或周圍組織造成明顯侵害，通過手術可完整切除畸胎瘤，術後結合放療或化療，預後較好。若心包內惡性畸胎瘤早期無明顯症狀，發現較晚，明顯浸潤心臟、主動脈、肺動脈和周圍組織，無法通過手術徹底切除，術後復發幾率大，預後較差。