功能性子宮出血需要首先排除器質性病變，存在器質性病變可能很難自行恢復，一般需要對患者進行B超檢查，有時需要做宮腔鏡檢查，甚至做腫瘤標誌物檢查排，除器質性病變包括子宮內膜息肉、腺肌症、肌瘤、惡性病變。

此外，排除以上情況以後，還要進行凝血功能檢查、內分泌檢查，有時還需要監測排卵，或者測量基礎體溫明確患者有無排卵，最終才能給出功能性子宮出血的診斷以及可能的原因，根據原因進行下一步的治療指導。