三個月寶寶房間隔缺損9mm，具體處理措施需根據寶寶有無症狀出現決定。房間隔缺損的症狀出現較晚，即使房缺較大也不會出現症狀，因為房缺分流到肺內部的血相對較少，也較晚，並不像室間隔缺損分流量大，且早期便出現症狀。如果孩子有症狀出現，應及早干預。另外，症狀出現較遲，不用處理，可以等到症狀出現後，即6個月以上可以做房間隔缺損手術。

如果房間隔缺損9mm，通常手術修補為主，因為較大的缺損做微創、做介入都較難做，而手術修補相對較安全。在6個月以上做較好，但如果早期3個月時房間隔缺損9mm，出現反覆肺炎史或者生過一次肺炎，且有手術指徵，也應早期行手術治療。即3-4個月患兒也可以進行房間隔缺損修補手術。