兒童期顱內感染腦膜炎可通過積極抗感染治療以及對症處理，達到有效控制甚至治癒。顱內感染存在不同病原體，包括病毒性腦炎、細菌性腦膜炎、結核性腦膜炎、脂溢性腦膜炎、寄生蟲腦膜炎、真菌性腦膜炎。不同病原體腦膜炎治療方法以及治療療效不同。最常見的病毒性腦膜炎、細菌性腦膜炎，通過抗生素治療或抗病毒治療，大部分兒童可以治癒，甚至對神經系統功能影響較小。

寄生蟲感染、中樞神經系統感染腦膜炎或真菌性、結核菌感染導致腦膜炎，治療時間相對較長。通過規範、長期、有效治療，大部分兒童可以控制。小部分兒童由於產生嚴重併發症可以出現生命危險，或治療恢復期影響神經系統功能障礙，留下較嚴重後遺症，對生活帶來嚴重影響。