小兒腦腫瘤切除後可能合併後遺症，主要是由瘤體或者手術所造成的神經功能受損所致。在手術切除腫瘤的過程中，往往由於腫瘤組織與腦組織的粘連或手術切除的需要而造成一些腦神經組織的受損，從而產生一些相應的臨床症狀，比如出現肢體麻木、疼痛、運動不靈、語言不利等等症狀。不能完全切除的腫瘤，其殘餘的腫瘤瘤體的存在將繼續產生對局部腦組織的壓迫，而表現出各種不適症狀，如頭痛、頭暈、噁心、嘔吐等，這些都是腦瘤術後後遺症的表現，需要通過後期的康復治療來解決腦瘤的後遺症。

根據腦腫瘤的性質和發生部位的不同，決定了手術後後遺症會有不同的表現。惡性腫瘤病情進展比較快，術後複發率高。良性腫瘤術後預後較好，後顱窩腫瘤手術後容易出現顱內壓症狀、腦積水、顱內感染、腦脊液漏、頭暈、共濟失調、行走不穩、尿失禁、痙攣性腦癱、呼吸循環衰竭；幕上腫瘤術後容易出現精神障礙、癲癇、偏癱、失語、昏迷、植物狀態；顱底腫瘤術後容易出現視力下降、視野缺損、複視、尿崩、水電解質紊亂、嗜睡、發育障礙以及消化道出血等。