月經期頭疼有很多原因，具體如下：

1、經前緊張綜合徵，中醫稱為經行頭痛，和內分泌有關係，因為激素水平變化使頭部血管有小的痙攣，會出現頭痛的情況，是因為內分泌導致前列腺素變化；

2、有的患者本身有偏頭痛，在經期或者月經前後會加重；

3、女性在月經期情緒存在波動，中醫上是肝鬱血虛，以致血不養經，在月經期就會出現頭痛。

如果頭痛症狀輕，可服用舒肝的藥物，比如逍遙丸。如果頭痛很嚴重，需要做進一步的檢查，比如做頭顱血管超聲看有無其它異常。如果患者頭疼很厲害，明確是月經引起的頭痛，可以服用止疼藥。