高原反應引起的頭疼，治療主要通過以下幾個方面進行處理：

第一、吸氧，高原反應是由於高原地區空氣稀薄容易引起大腦缺血、缺氧，導致頭暈、頭痛，低流量吸氧有助於改善大腦缺血、缺氧，緩解頭暈、頭痛，提高人體對缺氧環境的耐受性。

第二、藥物治療，如果持續性的頭痛嚴重影響日常生活，可以服用非甾體類的消炎止痛藥物，如布洛芬緩釋膠囊、氨咖甘片，有助於緩解頭痛症狀。

第三、中醫理療，如針灸、穴位按摩，可促進頭部血液循環，放鬆筋骨，有利於緩解頭痛，注意休息，避免劇烈活動，如果症狀持續不緩解，可以將患者轉移到低海拔的地區進一步治療。