不典型巨結腸只是一個概念問題，醫學上沒有不典型巨結腸，是與巨結腸症狀類似的病症，可能表現為便秘、腹脹或者久不排便，通過各種方式輔助才能排出大便。不典型巨結腸不是真正的疾病，可能是其它很多原因所致，如腸功能不良、胃腸蠕動功能較弱、結腸傳輸力量較弱。

不典型巨結腸表現類似於巨結腸，但影像學表現沒有真正的病理性改變，如嚴重的結腸擴張以及腸道典型的痙攣段、移行段、擴張段，所以不典型巨結腸只是病症，不是真正的疾病。